Оперативна програма „Транспорт" 2007-2013 г. (ОПТ) е с най-голям бюджет от всички седем оперативни програми в България - 2 003 481 163.68 евро.
Целта на ОПТ е развитието на железопътната, пътната и водна инфраструктура, както и стимулиране развитието на комбиниран транспорт в съответствие с транспортната политика на Европейския съюз и установените изисквания за развитие на Tранс-европейската транспортна мрежа за постигне на устойчивост на българската транспортна система. Спeцифичното в ОПТ е предварителното определяне на конкретните бенефициенти по проектите и предварителното приоритизиране на индикативен списък с инфраструктурни проекти, предвидени за финасиране от програмата.
Оперативната програма се фокусира върху няколко стратегически приоритета, които ще допринесат за интегрирането на националната транспортна мрежа в тази на ЕС. Бенефициентите по различните приоритетни оси са както следва:
1. Приоритетна ос - Развитие на железопътната инфраструктура по Транс-европейските и основните национални транспортни оси – Национална компания "Железопътна инфраструктура"
2. Приоритетна ос - Развитие на пътната инфраструктура по Транс-европейските и основните национални транспортни оси -Агенция "Пътна инфраструктура"
3. Приоритетна ос - Подобряване на интермодалността при превозите на пътници и товари- Столична община - „Метрополитен" ЕАД; Национална компания „Железопътна инфраструктура"
4. Приоритетна ос - Подобряване на корабоплаването по морските и вътрешните водни пътища - Изпълнителна агенция „Проучване и поддържане на река Дунав"; Държавно предприятие "Пристанищна инфраструктура".
5. Приоритетна ос - Техническа помощ- Управляващ орган на ОПТ; всички бенефициенти.